分子動态法英文解釋翻譯、分子動态法的近義詞、反義詞、例句
英語翻譯:
【化】 molecular dynamic method; molecular dynamic methodMD
分詞翻譯:
分子的英語翻譯:
element; member; molecule; numerator
【計】 molecusar
【化】 molecule
【醫】 molecule
動态的英語翻譯:
dynamic; dynamic state; trends
【經】 movement
法的英語翻譯:
dharma; divisor; follow; law; standard
【醫】 method
【經】 law
專業解析
分子動态法(Molecular Dynamics,簡稱MD)是一種基于經典力學或量子力學原理的計算模拟方法,主要用于研究原子、分子等微觀粒子在時間維度上的運動規律與相互作用。該方法通過數值求解牛頓運動方程或薛定谔方程,模拟體系在特定熱力學條件下的動态行為,為材料科學、生物物理、藥物設計等領域提供理論依據。
1. 基本原理
分子動态法以牛頓第二定律為核心,通過計算粒子受力後的加速度、速度和位置變化,疊代更新體系狀态。其基本公式為:
$$
F_i = m_i frac{d r_i}{dt}
$$
其中$F_i$表示第$i$個粒子所受合力,$m_i$為質量,$r_i$為位置矢量。經典MD采用經驗勢函數(如Lennard-Jones勢、AMBER力場)描述粒子間相互作用,而量子MD則需求解薛定谔方程。
2. 應用領域
- 材料科學:模拟合金相變、納米材料力學性能(來源:《物理評論B》期刊)
- 生物領域:研究蛋白質折疊、酶催化機制(來源:美國國家生物技術信息中心NCBI)
- 藥物研發:預測藥物分子與靶标蛋白結合模式(來源:《自然·化學生物學》)
3. 算法實現步驟
典型MD模拟流程包括:①構建初始體系結構;②選擇力場參數;③能量最小化預處理;④設定積分步長(常為1-2飛秒);⑤平衡态與生産态模拟;⑥軌迹分析與可視化。算法收斂性依賴于截斷半徑選擇與周期性邊界條件設置。
4. 發展現狀
隨着高性能計算技術發展,現代MD可處理百萬原子級體系(如病毒衣殼模拟),并行算法與機器學習勢函數的結合進一步提升了計算精度(來源:《科學》期刊2023年綜述)。開源軟件如GROMACS、NAMD已成為領域标準工具。
網絡擴展解釋
分子動态法(Molecular Dynamics,簡稱MD)是一種基于物理原理的計算模拟方法,主要用于研究原子或分子體系隨時間的演化行為。它通過數值求解牛頓運動方程,模拟粒子在相互作用力下的運動軌迹,進而分析系統的結構、動力學及熱力學性質。以下是詳細解釋:
1.基本原理
- 核心思想:假設粒子(原子或分子)遵循經典力學規律,通過計算每個粒子受的力(由勢能函數決定),疊代更新其位置和速度,從而模拟體系的時間演化。
- 勢能函數:描述粒子間相互作用,常見形式包括:
- Lennard-Jones勢(適用于範德華力):
$$ V(r) = 4epsilon left[ left(frac{sigma}{r}right)^{12} - left(frac{sigma}{r}right) right] $$
- 庫侖勢(電荷間作用):
$$ V(r) = frac{q_i q_j}{4pi epsilon_0 r} $$
- 鍵合勢(如彈簧振子模型):
$$ V(r) = frac{1}{2}k(r - r_0) $$
2.模拟流程
- 初始化:設定粒子的初始位置、速度(通常服從玻爾茲曼分布)。
- 力計算:根據勢能函數計算每個粒子所受的合力。
- 數值積分:使用算法(如Verlet、Leapfrog)更新位置和速度。
- Verlet算法公式:
$$ r(t+Delta t) = 2r(t) - r(t-Delta t) + frac{F(t)}{m} Delta t $$
- 周期性邊界條件:避免有限尺寸效應,模拟宏觀體系。
- 數據采集:記錄軌迹、能量等,用于後續分析。
3.關鍵應用領域
- 生物分子:研究蛋白質折疊、酶催化機制、藥物與受體的結合。
- 材料科學:分析晶體缺陷、相變過程、納米材料力學性能。
- 流體與軟物質:模拟液體擴散、膠體自組裝、高分子鍊動力學。
4.優勢與局限性
- 優勢:
- 提供原子級分辨率,揭示微觀機制。
- 可研究非平衡态過程(如化學反應、機械拉伸)。
- 局限性:
- 時間尺度受限(通常為納秒至微秒級)。
- 依賴勢能函數的準确性(量子效應可能被忽略)。
5.發展趨勢
- 增強采樣技術:如副本交換(Replica Exchange)加速稀有事件模拟。
- 多尺度建模:結合量子力學(QM)與分子動力學(MM)的QM/MM方法。
- 機器學習勢函數:利用神經網絡提高計算效率與精度。
總結來看,分子動态法是連接微觀與宏觀世界的橋梁,廣泛應用于理論研究和工業設計。如需更深入的技術細節(如具體算法實現或案例分析),可進一步探讨。
分類
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