分子动态法英文解释翻译、分子动态法的近义词、反义词、例句
英语翻译:
【化】 molecular dynamic method; molecular dynamic methodMD
分词翻译:
分子的英语翻译:
element; member; molecule; numerator
【计】 molecusar
【化】 molecule
【医】 molecule
动态的英语翻译:
dynamic; dynamic state; trends
【经】 movement
法的英语翻译:
dharma; divisor; follow; law; standard
【医】 method
【经】 law
专业解析
分子动态法(Molecular Dynamics,简称MD)是一种基于经典力学或量子力学原理的计算模拟方法,主要用于研究原子、分子等微观粒子在时间维度上的运动规律与相互作用。该方法通过数值求解牛顿运动方程或薛定谔方程,模拟体系在特定热力学条件下的动态行为,为材料科学、生物物理、药物设计等领域提供理论依据。
1. 基本原理
分子动态法以牛顿第二定律为核心,通过计算粒子受力后的加速度、速度和位置变化,迭代更新体系状态。其基本公式为:
$$
F_i = m_i frac{d r_i}{dt}
$$
其中$F_i$表示第$i$个粒子所受合力,$m_i$为质量,$r_i$为位置矢量。经典MD采用经验势函数(如Lennard-Jones势、AMBER力场)描述粒子间相互作用,而量子MD则需求解薛定谔方程。
2. 应用领域
- 材料科学:模拟合金相变、纳米材料力学性能(来源:《物理评论B》期刊)
- 生物领域:研究蛋白质折叠、酶催化机制(来源:美国国家生物技术信息中心NCBI)
- 药物研发:预测药物分子与靶标蛋白结合模式(来源:《自然·化学生物学》)
3. 算法实现步骤
典型MD模拟流程包括:①构建初始体系结构;②选择力场参数;③能量最小化预处理;④设定积分步长(常为1-2飞秒);⑤平衡态与生产态模拟;⑥轨迹分析与可视化。算法收敛性依赖于截断半径选择与周期性边界条件设置。
4. 发展现状
随着高性能计算技术发展,现代MD可处理百万原子级体系(如病毒衣壳模拟),并行算法与机器学习势函数的结合进一步提升了计算精度(来源:《科学》期刊2023年综述)。开源软件如GROMACS、NAMD已成为领域标准工具。
网络扩展解释
分子动态法(Molecular Dynamics,简称MD)是一种基于物理原理的计算模拟方法,主要用于研究原子或分子体系随时间的演化行为。它通过数值求解牛顿运动方程,模拟粒子在相互作用力下的运动轨迹,进而分析系统的结构、动力学及热力学性质。以下是详细解释:
1.基本原理
- 核心思想:假设粒子(原子或分子)遵循经典力学规律,通过计算每个粒子受的力(由势能函数决定),迭代更新其位置和速度,从而模拟体系的时间演化。
- 势能函数:描述粒子间相互作用,常见形式包括:
- Lennard-Jones势(适用于范德华力):
$$ V(r) = 4epsilon left[ left(frac{sigma}{r}right)^{12} - left(frac{sigma}{r}right) right] $$
- 库仑势(电荷间作用):
$$ V(r) = frac{q_i q_j}{4pi epsilon_0 r} $$
- 键合势(如弹簧振子模型):
$$ V(r) = frac{1}{2}k(r - r_0) $$
2.模拟流程
- 初始化:设定粒子的初始位置、速度(通常服从玻尔兹曼分布)。
- 力计算:根据势能函数计算每个粒子所受的合力。
- 数值积分:使用算法(如Verlet、Leapfrog)更新位置和速度。
- Verlet算法公式:
$$ r(t+Delta t) = 2r(t) - r(t-Delta t) + frac{F(t)}{m} Delta t $$
- 周期性边界条件:避免有限尺寸效应,模拟宏观体系。
- 数据采集:记录轨迹、能量等,用于后续分析。
3.关键应用领域
- 生物分子:研究蛋白质折叠、酶催化机制、药物与受体的结合。
- 材料科学:分析晶体缺陷、相变过程、纳米材料力学性能。
- 流体与软物质:模拟液体扩散、胶体自组装、高分子链动力学。
4.优势与局限性
- 优势:
- 提供原子级分辨率,揭示微观机制。
- 可研究非平衡态过程(如化学反应、机械拉伸)。
- 局限性:
- 时间尺度受限(通常为纳秒至微秒级)。
- 依赖势能函数的准确性(量子效应可能被忽略)。
5.发展趋势
- 增强采样技术:如副本交换(Replica Exchange)加速稀有事件模拟。
- 多尺度建模:结合量子力学(QM)与分子动力学(MM)的QM/MM方法。
- 机器学习势函数:利用神经网络提高计算效率与精度。
总结来看,分子动态法是连接微观与宏观世界的桥梁,广泛应用于理论研究和工业设计。如需更深入的技术细节(如具体算法实现或案例分析),可进一步探讨。
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