
【機】 protein sequence
albumin; protein
【化】 protein
【醫】 albuminoid; albumoid; proteic substance
alignment; array; sequence; serial; series
【計】 list
【化】 sequence
【經】 array
system; scheme
【計】 system
【化】 system
【醫】 system; systema
【經】 channel; system
happen; generate; occur; take place; engender; exist; go forward; go on
originate
【醫】 genesis; occurrence
蛋白質序列系統發生(Protein Sequence Phylogeny)是生物信息學和分子進化領域的重要概念,其核心含義如下:
蛋白質序列(Protein Sequence)
指蛋白質中氨基酸殘基的線性排列順序,是基因編碼的翻譯産物。英文對應 "Protein Sequence",強調其作為生物大分子的一級結構。
系統發生(Phylogeny)
源于希臘語 phylon(種族)和 genesis(起源),指物種或分子間的演化曆史與親緣關系。英文為 "Phylogeny",常通過系統發生樹(Phylogenetic Tree)可視化呈現。
蛋白質序列系統發生
綜合術語,指通過比較不同物種同源蛋白質的序列差異,推斷其進化關系和共同祖先的過程。英文表述為 "Protein Sequence Phylogeny" 或 "Phylogenetic Analysis of Protein Sequences"。
理論基礎
同源蛋白質(由共同祖先基因演化而來)的序列相似性反映物種進化距離。序列保守區域指示功能重要性,變異區域記錄演化事件。
關鍵步驟:
應用場景:
《分子進化與系統發生》(Molecular Evolution and Phylogenetics):
"蛋白質序列系統發生是通過統計模型分析同源蛋白質序列,重建物種分化或基因複制事件的時間序列。" (Nei & Kumar, 2000)
來源:牛津大學出版社學術專著(ISBN 978-0195135855)。
UniProt 知識庫:
強調系統發生分析對理解蛋白質功能分化的必要性,如酶家族的功能特異性演化案例。
來源:UniProt 功能注釋指南。
NCBI 技術文檔:
系統描述基于 BLASTP 同源搜索與 MEGA 軟件構建蛋白質系統樹的标準化流程。
該研究整合了生物化學、計算生物學與進化生物學,為生命起源探索、物種分類修訂(如微生物分類)及藥物靶點保守性評估提供核心方法論支撐。
“蛋白質序列系統發生”是一個結合了分子生物學和進化生物學的術語,需拆解為兩部分理解:
指蛋白質分子中氨基酸的排列順序(一級結構),決定了其三維構象和功能。
指研究生物類群間進化關系的方法,常通過比較基因或蛋白質序列的差異來構建進化樹。
“蛋白質序列系統發生”指利用蛋白質序列數據,通過系統發育分析方法,揭示生物或基因的進化曆史。其核心步驟包括:
該方法廣泛應用于物種分類、功能基因演化研究等領域。
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