
【机】 protein sequence
albumin; protein
【化】 protein
【医】 albuminoid; albumoid; proteic substance
alignment; array; sequence; serial; series
【计】 list
【化】 sequence
【经】 array
system; scheme
【计】 system
【化】 system
【医】 system; systema
【经】 channel; system
happen; generate; occur; take place; engender; exist; go forward; go on
originate
【医】 genesis; occurrence
蛋白质序列系统发生(Protein Sequence Phylogeny)是生物信息学和分子进化领域的重要概念,其核心含义如下:
蛋白质序列(Protein Sequence)
指蛋白质中氨基酸残基的线性排列顺序,是基因编码的翻译产物。英文对应 "Protein Sequence",强调其作为生物大分子的一级结构。
系统发生(Phylogeny)
源于希腊语 phylon(种族)和 genesis(起源),指物种或分子间的演化历史与亲缘关系。英文为 "Phylogeny",常通过系统发生树(Phylogenetic Tree)可视化呈现。
蛋白质序列系统发生
综合术语,指通过比较不同物种同源蛋白质的序列差异,推断其进化关系和共同祖先的过程。英文表述为 "Protein Sequence Phylogeny" 或 "Phylogenetic Analysis of Protein Sequences"。
理论基础
同源蛋白质(由共同祖先基因演化而来)的序列相似性反映物种进化距离。序列保守区域指示功能重要性,变异区域记录演化事件。
关键步骤:
应用场景:
《分子进化与系统发生》(Molecular Evolution and Phylogenetics):
"蛋白质序列系统发生是通过统计模型分析同源蛋白质序列,重建物种分化或基因复制事件的时间序列。" (Nei & Kumar, 2000)
来源:牛津大学出版社学术专著(ISBN 978-0195135855)。
UniProt 知识库:
强调系统发生分析对理解蛋白质功能分化的必要性,如酶家族的功能特异性演化案例。
来源:UniProt 功能注释指南。
NCBI 技术文档:
系统描述基于 BLASTP 同源搜索与 MEGA 软件构建蛋白质系统树的标准化流程。
该研究整合了生物化学、计算生物学与进化生物学,为生命起源探索、物种分类修订(如微生物分类)及药物靶点保守性评估提供核心方法论支撑。
“蛋白质序列系统发生”是一个结合了分子生物学和进化生物学的术语,需拆解为两部分理解:
指蛋白质分子中氨基酸的排列顺序(一级结构),决定了其三维构象和功能。
指研究生物类群间进化关系的方法,常通过比较基因或蛋白质序列的差异来构建进化树。
“蛋白质序列系统发生”指利用蛋白质序列数据,通过系统发育分析方法,揭示生物或基因的进化历史。其核心步骤包括:
该方法广泛应用于物种分类、功能基因演化研究等领域。
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