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鄰接法英文解釋翻譯、鄰接法的近義詞、反義詞、例句

英語翻譯:

【計】 adjacent method

分詞翻譯:

鄰接的英語翻譯:

neighbor; adjacency; abut; abut upon; abutment; adjoin; bound
【機】 adjoin

法的英語翻譯:

dharma; divisor; follow; law; standard
【醫】 method
【經】 law

專業解析

鄰接法(Neighbor-Joining Method)是系統發育學中用于構建進化樹的一種距離矩陣算法,由Saitou和Nei于1987年提出。其英文全稱為"Neighbor-Joining Method",簡稱NJ法,屬于非加權配對算術平均法(UPGMA)的改進版本,通過最小化分枝長度總疊代計算來推定物種間的親緣關系。

該方法的三個核心特點:

  1. 非時鐘假設:不預設分子鐘理論,適用于進化速率不均等的生物類群
  2. 計算效率:時間複雜度為O(n³),適合處理中等規模(50-500個分類單元)的數據集
  3. 拓撲優化:通過Q矩陣計算最小進化準則,優先合并使總樹長最小的節點對

在分子進化研究中,鄰接法常與以下數據配合使用:

數學表達上,疊代過程遵循: $$ S{ij} = frac{1}{2}(d{ik} + d{jk} - d{ij}) $$ 其中$d{ij}$表示分類單元i與j的遺傳距離,$S{ij}$為分枝節點k到i,j的路徑長度。每輪疊代将Q值最小的兩個類群合并,直至完成拓撲構建。

參考文獻:

  1. Saitou N, Nei M. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. Molecular Biology and Evolution. 1987
  2. Felsenstein J. Inferring Phylogenies. Sinauer Associates; 2004

網絡擴展解釋

“鄰接法”(Neighbor-Joining,簡稱NJ法)是一種常用于構建系統發育樹(進化樹)的算法,主要用于生物信息學或分子生物學領域,通過分析物種間遺傳距離推斷進化關系。以下是詳細解釋:


定義與原理

鄰接法是一種基于距離矩陣的聚類方法,由Saitou和Nei于1987年提出。它通過疊代合并距離最近的節點(或分類單元),逐步構建無根樹,最終形成樹狀拓撲結構。其核心思想是最小化樹的總分支長度,尤其適用于序列間進化距離差異較大的情況。


步驟概述

  1. 計算距離矩陣:根據基因序列差異(如堿基替換率)生成所有物種間的距離矩陣。
  2. 确定合并節點:計算每對節點的合并代價(Q值),選擇Q值最小的兩個節點合并為新節點。
  3. 更新距離矩陣:重新計算新節點與其他節點間的距離,疊代合并直至所有節點連接成樹。

特點與優缺點


應用領域

主要用于分子進化分析,例如:


如需了解具體計算過程或公式,可參考生物信息學工具(如MEGA、Phylip)的實現方式,或查看原始文獻。

分類

ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ

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