
【化】 ornithyl
bird; fowl; jay
【化】 aminoacyl
鳥氨酰基(Ornithinyl)是氨基酸鳥氨酸(L-ornithine)通過其α-氨基與其他分子結合形成的酰基官能團。該術語在生物化學領域主要用于描述肽鍊或化合物中與鳥氨酸相關的結構單元。其英文定義為"a functional group derived from ornithine by removal of a hydrogen atom from the amino group",強調其作為氨基酸衍生物的特性(來源:IUPAC Gold Book)。
從結構上看,鳥氨酰基由鳥氨酸的α-氨基脫去一個氫原子形成,化學式為C₅H₁₁N₂O₂⁻,可通過以下結構式表示: $$ ce{H2N-(CH2)3-CH(NH2)-COO^-} $$ 這一特征結構使其在生物體内具有特殊的分子識别功能(來源:PubChem)。
在生物醫學領域,含有鳥氨酰基結構的化合物常出現在抗菌肽中。例如短杆菌肽S(Gramicidin S)通過鳥氨酰基與其他氨基酸形成環狀結構,這種構象對抗菌活性具有決定性作用(來源:RCSB PDB)。近年研究發現,該基團在腫瘤靶向藥物的載體設計中也顯示出應用潛力(來源:Scripps Research)。
“鳥氨酰基”(ornithyl)是由氨基酸鳥氨酸(ornithine)衍生而來的酰基結構。以下是綜合解釋:
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