
【化】 ornithyl
bird; fowl; jay
【化】 aminoacyl
鸟氨酰基(Ornithinyl)是氨基酸鸟氨酸(L-ornithine)通过其α-氨基与其他分子结合形成的酰基官能团。该术语在生物化学领域主要用于描述肽链或化合物中与鸟氨酸相关的结构单元。其英文定义为"a functional group derived from ornithine by removal of a hydrogen atom from the amino group",强调其作为氨基酸衍生物的特性(来源:IUPAC Gold Book)。
从结构上看,鸟氨酰基由鸟氨酸的α-氨基脱去一个氢原子形成,化学式为C₅H₁₁N₂O₂⁻,可通过以下结构式表示: $$ ce{H2N-(CH2)3-CH(NH2)-COO^-} $$ 这一特征结构使其在生物体内具有特殊的分子识别功能(来源:PubChem)。
在生物医学领域,含有鸟氨酰基结构的化合物常出现在抗菌肽中。例如短杆菌肽S(Gramicidin S)通过鸟氨酰基与其他氨基酸形成环状结构,这种构象对抗菌活性具有决定性作用(来源:RCSB PDB)。近年研究发现,该基团在肿瘤靶向药物的载体设计中也显示出应用潜力(来源:Scripps Research)。
“鸟氨酰基”(ornithyl)是由氨基酸鸟氨酸(ornithine)衍生而来的酰基结构。以下是综合解释:
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