
【化】 consensus sequence
community; in common; intercommunity; share
【经】 co-ownership; community
alignment; array; sequence; serial; series
【计】 list
【化】 sequence
【经】 array
在汉英词典框架下,"共有序列"对应的英文术语为"consensus sequence",指多个同源生物大分子(DNA、RNA或蛋白质)经序列比对后确定的保守性特征序列。该概念包含三个核心特征:
保守性特征 通过统计学分析同源序列高频出现的碱基或氨基酸位点构成,如核糖体结合位点的Shine-Dalgarno序列(5'-AGGAGG-3'),该模式在《Nucleic Acids Research》期刊中被证实存在于75%原核生物基因中。
功能指示性 共有序列标识关键功能区域,例如真核生物启动子区的TATA盒(TATAAA)作为RNA聚合酶识别位点,该结论获美国国家生物技术信息中心(NCBI)的分子生物学数据库支持。
序列容许度 允许存在有限变异,但需维持功能完整性。如蛋白质酶的催化三联体(GXSXG)在《Biochemical Journal》记载中,第二位的丝氨酸可被半胱氨酸替代而不影响活性。
该术语最早由Dayhoff在1978年蛋白质图谱研究中提出,现代应用已扩展至CRISPR基因编辑的PAM序列识别等前沿领域。牛津大学出版的《Dictionary of Biochemistry and Molecular Biology》将其定义为"进化过程中保留下来的功能性核苷酸/氨基酸排列模式"。
共有序列(Consensus Sequence)是生物学中用于描述一组相似但不完全相同的DNA、RNA或蛋白质序列中高度保守的碱基或氨基酸排列模式。以下从定义、特点和应用三方面详细解释:
定义与形成
共有序列是通过比对多个功能相关的序列,统计每个位点最常出现的碱基或氨基酸而形成的一种“理想化”序列。例如,在原核生物基因的启动子区域,-10区(TATAAT)和-35区(TTGACA)的共有序列是RNA聚合酶识别并结合的关键位点。
核心特点
应用场景
误区提醒:共有序列并非所有原始序列的完全一致排列,而是统计意义上的“最佳代表”。例如,启动子的共有序列可能仅部分核苷酸严格保守,其他位置允许一定变异。
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