
【化】 consensus sequence
community; in common; intercommunity; share
【經】 co-ownership; community
alignment; array; sequence; serial; series
【計】 list
【化】 sequence
【經】 array
在漢英詞典框架下,"共有序列"對應的英文術語為"consensus sequence",指多個同源生物大分子(DNA、RNA或蛋白質)經序列比對後确定的保守性特征序列。該概念包含三個核心特征:
保守性特征 通過統計學分析同源序列高頻出現的堿基或氨基酸位點構成,如核糖體結合位點的Shine-Dalgarno序列(5'-AGGAGG-3'),該模式在《Nucleic Acids Research》期刊中被證實存在于75%原核生物基因中。
功能指示性 共有序列标識關鍵功能區域,例如真核生物啟動子區的TATA盒(TATAAA)作為RNA聚合酶識别位點,該結論獲美國國家生物技術信息中心(NCBI)的分子生物學數據庫支持。
序列容許度 允許存在有限變異,但需維持功能完整性。如蛋白質酶的催化三聯體(GXSXG)在《Biochemical Journal》記載中,第二位的絲氨酸可被半胱氨酸替代而不影響活性。
該術語最早由Dayhoff在1978年蛋白質圖譜研究中提出,現代應用已擴展至CRISPR基因編輯的PAM序列識别等前沿領域。牛津大學出版的《Dictionary of Biochemistry and Molecular Biology》将其定義為"進化過程中保留下來的功能性核苷酸/氨基酸排列模式"。
共有序列(Consensus Sequence)是生物學中用于描述一組相似但不完全相同的DNA、RNA或蛋白質序列中高度保守的堿基或氨基酸排列模式。以下從定義、特點和應用三方面詳細解釋:
定義與形成
共有序列是通過比對多個功能相關的序列,統計每個位點最常出現的堿基或氨基酸而形成的一種“理想化”序列。例如,在原核生物基因的啟動子區域,-10區(TATAAT)和-35區(TTGACA)的共有序列是RNA聚合酶識别并結合的關鍵位點。
核心特點
應用場景
誤區提醒:共有序列并非所有原始序列的完全一緻排列,而是統計意義上的“最佳代表”。例如,啟動子的共有序列可能僅部分核苷酸嚴格保守,其他位置允許一定變異。
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