
【化】 peptidyl site
【化】 peptide
【医】 peptid; peptide; phthalein
【机】 root
digit; location; place; potential; throne
【计】 D
【化】 bit
【医】 P; position
【经】 bit
在生物化学领域,"肽基部位"(英文:Peptidyl Site,简称P-site)特指核糖体上结合正在延伸的多肽链-tRNA复合物的关键功能位点。以下是其详细解释:
位置与功能
肽基部位是核糖体大亚基上的两个主要tRNA结合位点之一(另一个是氨酰基位点/A-site)。它负责容纳携带新生肽链的tRNA(肽基-tRNA)。当新的氨基酸在A-site通过肽键连接到肽链后,整个肽链会转移到P-site的tRNA上,驱动肽链延伸 。
化学本质
"肽基"(Peptidyl)指由肽键(-CO-NH-)连接的氨基酸残基组成的基团。在P-site中,肽基-tRNA的CCA末端(携带肽链的部分)与核糖体紧密结合,确保翻译的准确性 。
当氨酰-tRNA进入A-site后,核糖体催化P-site上肽基-tRNA的羧基与A-site氨基酸的氨基形成肽键,随后肽链转移至A-site tRNA。移位(Translocation)后,原A-site的tRNA(现携带肽链)移至P-site,为下一轮延伸做准备 。
P-site的精准定位保障了mRNA密码子与tRNA反密码子的对应,避免翻译错误。若P-site功能异常,将导致肽链延伸终止或产生错误蛋白 。
Nelson, D. L., & Cox, M. M. (8th ed.). W.H. Freeman. ISBN: 9781319228002.
(第30章详细描述核糖体P-site在翻译中的作用)
Alberts, B., et al. (7th ed.). Garland Science. ISBN: 9781317563754.
(第6章阐释核糖体结构与功能)
中文 | 英文 | 缩写 |
---|---|---|
肽基部位 | Peptidyl Site | P-site |
氨酰基部位 | Aminoacyl Site | A-site |
肽基-tRNA | Peptidyl-tRNA | - |
移位 | Translocation | - |
肽基部位(又称肽基或肽单位)是蛋白质肽链中的基本结构单元,具体指由肽键连接形成的平面结构部分。以下是详细解释:
结构组成 肽基部位包含以下原子和基团:
平面刚性特征 这些原子和基团共同构成一个近似平面的刚性结构。这种平面性源于肽键的部分双键特性(共振杂化作用),导致C-N键无法自由旋转,从而维持了结构的稳定性。
生物学意义 该平面结构是蛋白质二级结构(如α-螺旋、β-折叠)形成的基础。多个肽基部位的排列方式直接影响蛋白质主链的空间构象,对维持蛋白质功能至关重要。
补充说明:疏水内核(蛋白质内部的疏水区域)与肽基部位的协同作用,共同维持蛋白质三维结构的稳定(相关机制可参考疏水作用力与氢键的相互作用)。
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