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分子碎片法英文解释翻译、分子碎片法的近义词、反义词、例句

英语翻译:

【化】 molecular fragment method

分词翻译:

分子的英语翻译:

element; member; molecule; numerator
【计】 molecusar
【化】 molecule
【医】 molecule

碎片的英语翻译:

fragment; patch; piece; rag; chip; debris; scrap; shatter; splinter
【计】 junk shop
【医】 chip; fragment; ramenta; Ras.; rasura; shreds
【经】 scrap

法的英语翻译:

dharma; divisor; follow; law; standard
【医】 method
【经】 law

专业解析

分子碎片法(Fragment Molecular Orbital Method, FMO)是一种用于大分子体系量子化学计算的高效方法。其核心思想是将复杂分子系统分割成较小的、易于计算的碎片(fragments),通过计算这些碎片及其相互作用的量子化学性质,再重组得到整个体系的近似结果。该方法显著降低了计算资源需求,适用于蛋白质、核酸等生物大分子的电子结构分析。

一、核心原理与步骤

  1. 分子分割

    将目标分子(如蛋白质)划分为若干碎片(如氨基酸残基),每个碎片包含若干原子。分割需遵循化学合理性(如保留官能团完整性)。

  2. 碎片计算与相互作用修正

    • 计算单碎片(FMO1)和双碎片对(FMO2)的电子结构,后者用于描述碎片间的量子相互作用(如氢键、电荷转移)。
    • 体系总能量由碎片能量与碎片对相互作用能叠加得到:

      $$ E{text{total}} approx sum{I} EI + sum{I>J} (E_{IJ} - E_I - E_J) $$

      其中 (EI) 为碎片 (I) 的能量,(E{IJ}) 为碎片对 (I-J) 的能量。

  3. 重组与性质分析

    整合碎片计算结果,重构分子轨道、电子密度及能量性质(如结合能、静电势),实现大体系的高精度模拟。

二、应用场景与优势

三、权威定义与参考文献

  1. IUPAC术语库

    定义碎片法为"基于分子分割的近似量子化学方法"(Compendium of Chemical Terminology)。

    来源: Gold Book: Fragment Molecular Orbital Method (国际纯粹与应用化学联合会)

  2. ACS出版物

    Kitaura等提出FMO框架,阐明其应用于蛋白质电子结构预测的可行性(Journal of Chemical Physics)。

    来源: Kitaura K, et al. J. Chem. Phys. 1999, 110, 1197

  3. 计算方法综述

    Fedorov等系统讨论FMO算法优化及生物医学案例(Chemical Reviews)。

    来源: Fedorov DG, et al. Chem. Rev. 2012, 112, 632

  4. 软件实现

    GAMESS、ABINIT-MP等开源程序集成FMO模块,支持并行化大规模计算。

    来源: GAMESS FMO Manual

网络扩展解释

分子碎片法(Molecular Fragment Method)是一种在药物设计与化学研究中常用的技术,其核心是通过分解复杂分子为更小的结构单元(碎片),再利用这些碎片进行新化合物的设计与分析。

核心原理与应用

  1. 本质与目的
    将大分子化合物分解为质量更小、结构简单的碎片,通过分析碎片的性质(如构象、相互作用)为药物设计提供信息。例如,研究小分子与生物靶标(如蛋白质)的相互作用,从而优化药物活性与选择性。

  2. 主要步骤

    • 筛选与解析:通过高通量筛选从化合物库中选出潜在活性碎片,并利用X射线晶体学、核磁共振等技术确定结构。
    • 模拟与评价:结合分子动力学模拟探索作用机制,最后通过生物活性实验验证碎片对靶标的影响。
  3. 应用价值
    该方法显著提升了药物研发效率,尤其在发现新药先导化合物时,能够快速构建多样化分子库并优化药效。

补充说明

如需进一步了解具体技术细节或案例,可参考药物设计领域的专业文献。

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