
【化】 internal coordinate
在数学和物理学中,"内坐标"(Internal Coordinates)指描述系统内部相对运动的坐标,区别于描述整体运动的"外坐标"。其核心在于通过系统各部分间的相对关系(如距离、角度)来定义构型,消除整体平动和转动自由度。以下是具体解析:
本质属性
内坐标直接表征系统内部各组分间的几何关系。例如在分子系统中,键长(Bond Length)、键角(Bond Angle)、二面角(Dihedral Angle)构成典型内坐标,数学表达为:
$$ begin{aligned} r_{ij} &= |mathbf{r}i - mathbf{r}j| theta{ijk} &= cos^{-1}left( frac{mathbf{r}{ij} cdot mathbf{r}{kj}}{r{ij}r{kj}} right) phi{ijkl} &= cos^{-1}left( frac{(mathbf{r}{ij} times mathbf{r}{kj}) cdot (mathbf{r}{kj} times mathbf{r}{kl})}{|mathbf{r}{ij} times mathbf{r}{kj}| cdot |mathbf{r}{kj} times mathbf{r}{kl}|} right) end{aligned} $$ 其中 (mathbf{r}_i) 为原子位置矢量。
自由度缩减
对含 (N) 个质点的系统,内坐标仅需 (3N-6)(非线性分子)或 (3N-5)(线性分子)个变量,而笛卡尔坐标需 (3N) 个,有效降低了计算复杂度。
分子动力学模拟
内坐标可避免分子整体平动/转动引入的伪力,提升能量梯度计算效率。例如在蛋白质构象分析中,二面角变化直接对应主链旋转,是研究折叠机制的关键变量。
结构力学分析
在有限元分析中,内坐标用于描述梁、板等结构的局部变形(如应变能计算),与材料本构方程直接关联。
权威参考来源:
- Goldstein, H. Classical Mechanics (键角与二面角定义)
- Schlick, T. Molecular Modeling and Simulation (自由度缩减原理)
- Brooks, B.R. Journal of Computational Chemistry (蛋白质构象应用)
- Cook, R.D. Finite Element Modeling for Stress Analysis (结构力学案例)
关于“内坐标”这一专业术语的解释如下:
内坐标(Internal coordinates)是相对于外坐标(笛卡尔坐标)的一种坐标系统,主要用于描述系统内部各元素之间的相对位置关系,而非基于绝对空间坐标系。其特点包括:
化学领域(分子结构)
机械工程(机器人学)
振动分析
对于平面三原子分子ABC:
特征 | 内坐标 | 笛卡尔坐标 |
---|---|---|
参数类型 | 相对量 | 绝对量 |
自由度 | 仅含必要自由度 | 包含全部自由度 |
适用场景 | 结构优化、振动分析 | 空间定位 |
该解释综合了化学、物理和工程领域的通用定义,具体应用中的参数设置会因学科差异而有所不同。建议查阅《结构化学》或《机器人运动学》等专业教材获取更系统的理论阐述。
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