
n. 基因库;基因银行
The sequence of cloned PDZ1 was identical with that reported in GenBank.
PDZ1测序图谱与文献报道完全一致。
The homology of Giardia canis virus to sequence of L13218(GenBank) was 94.62% in the nucleotide, and 93.50% in the amino acid levels.
其序列与国外报道的人源蓝氏贾第虫病毒(L13218) 序列同源性为94.62%,编码的氨基酸同源性为93.50%;
Many databases and tools of bioinformatics, such as GenBank, EMBL, DDBJ, and SWISS-PROT, are important resources for molecular breeding research.
Prot等数据库及其序列查询系统、 序列比对软件和序列提交软件是园艺植物分子育种中的重要生物信息资源。
They then compared the sequences they got back with known sequences listed in the GenBank database maintained by the US National Library of Medicine.
随后,他们将测得的序列与美国国立医学图书馆基因库中的已知序列进行比对。
The following work were done in this study: (1)TK and P32 gene of GTPV-TY were cloned by PCR with primer pairs designed by information published on GENBANK;
主要进行了以下工作:(1)根据GENBANK公布的羊痘病毒基因组序列设计引物,利用PCR克隆GTPV-TY株TK基因和P32基因;
n.|gene pool/gene bank;基因库;基因银行
GenBank是由美国国家生物技术信息中心(NCBI)建立并维护的全球最大的公开核酸序列数据库。它作为国际核酸序列数据库协作(INSDC)的核心成员,与欧洲的ENA和日本的DDBJ共同构成全球性的序列数据共享网络,每日同步更新数据。
序列存储
收录来自全球科研机构提交的DNA、RNA序列数据,涵盖超30万种生物物种,包括基因组、转录组及注释信息。每个记录包含序列长度、来源生物、文献引用等元数据,并赋予唯一登录号(如KM000000)供检索。
数据提交与共享机制
研究者通过BankIt或Sequin工具提交数据,经格式校验后48小时内公开。所有数据遵循INSDC标准,实现与ENA、DDBJ的实时同步,确保数据全球可及(来源:NCBI官方文档)。
基础研究支持
为基因功能预测、物种进化分析提供关键数据,例如人类基因组计划数据即存储于此。研究人员通过BLAST工具可进行序列比对分析(来源:NIH白皮书)。
临床与产业应用
病原体序列数据库(如SARS-CoV-2序列)支撑疫情追踪;制药企业利用其筛选药物靶点,相关数据需通过NCBI的严格质量控制流程(来源:INSDC年度报告)。
由NIH、美国国家医学图书馆(NLM)及国际顾问委员会共同监管,执行FAIR数据原则(可查找、可访问、可交互、可重用)。所有数据经格式验证与生物来源审核,用户可通过FTP批量下载或API接口调用(来源:NLM政策文件)。
权威参考来源:
- 美国国家生物技术信息中心(NCBI):https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/
- 国际核酸序列数据库协作组织(INSDC):https://www.insdc.org/
- 美国国立卫生研究院(NIH):https://www.nih.gov/
GenBank是一个国际知名的生物信息学数据库,主要用于存储和共享公开的核酸序列(如DNA、RNA)及其注释信息。以下是其核心信息的详细解释:
定义与功能
GenBank由美国国家生物技术信息中心(NCBI)维护,是全球最大的公共基因序列数据库之一。它通过收集来自科研人员提交的数据及大规模测序项目的结果,提供序列的存储、注释和开放访问服务。
数据内容与结构
国际合作与关联数据库
GenBank是国际核酸序列数据库协作组织(INSDC)的成员,与欧洲的EMBL和日本的DDBJ实时同步数据,形成全球统一的资源网络。此外,NCBI还管理PubMed、BLAST等工具,与GenBank共同支持生物医学研究。
应用领域
该数据库为基因组学、进化生物学、疾病研究等提供基础数据,研究人员可通过BLAST工具进行序列比对,或结合PubMed文献深化分析。
如需进一步了解具体序列格式或检索方法,可参考NCBI官网或相关学术平台(如、5、9)。
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