
[物] 分子动力学
In the computer simulations, the Discrete Molecular Dynamics (DMD) method was induced.
在计算机模拟方面,我们引入了离散分子动力学(DMD)方法。
Nuclear magnetic resonance has proved to be very useful in studying molecular dynamics.
核磁共振波谱学在动力学研究上具有非常独特的优势。
Cyclic mapping and reduction recursive bisection method were used to parallel the molecular dynamics.
分别用循环映射法和简化递归对剖法实现了分子动力学的并行计算。
In this paper molecular dynamics (MD) simulation was applied to validate COMPASS force field for HMX.
首先通过分子动力学(MD)模拟考察了COMPASS力场对HMX的适用性。
The rheological behavior of nanometer-thick liquid film has been predicted by Molecular Dynamics Simulation.
本文以分子动力学方法模拟了纳米级液体薄膜的流变特性。
分子动力学(Molecular Dynamics,MD)是一种基于计算机模拟的计算方法,用于研究原子和分子在特定物理条件下的运动规律及其相互作用。以下是详细解释:
分子动力学通过数值求解牛顿运动方程,模拟粒子(如原子或分子)在势能场作用下的运动轨迹。其核心是计算每个粒子随时间演化的位置和速度,从而揭示系统的微观行为。
势能函数(力场)
描述原子间相互作用的数学模型,如键长、键角、二面角、范德华力和静电力。常用力场包括 AMBER、CHARMM 和 GROMOS。
积分算法
如 Verlet 算法或 Leap-Frog 算法,用于离散化时间步长(通常为 1 飞秒)并更新粒子位置和速度。
周期性边界条件
模拟体系通常被置于周期性重复的“盒子”中,以减小表面效应的影响。
热力学系综控制
通过 Berendsen 热浴或 Nosé-Hoover 方法调节温度、压力等参数,模拟不同热力学条件(如 NVT、NPT 系综)。
分子动力学通过原子层面的动态模拟,为理解物质行为提供了重要工具,广泛应用于科研和工业领域。如需具体案例或软件工具(如 LAMMPS、NAMD)的说明,可进一步探讨。
分子动力学是一种模拟和研究分子系统运动的计算方法。该方法基于牛顿力学和统计力学的原理,通过数值计算来模拟分子的运动轨迹和状态变化,以揭示分子的结构、动态和性质等方面的信息。在化学、材料科学、生物学、地球物理学等领域广泛应用。
分子动力学的主要应用领域包括:
分子动力学方法的基本思想是将分子系统中每个分子的运动视为受到原子间相互作用力的牛顿运动,通过求解牛顿方程来得到分子的运动轨迹和状态变化。其中,原子间相互作用力可以用势函数表示。分子动力学模拟过程中,通过数值计算方法求解牛顿方程,得到分子的运动轨迹和各种物理量的变化规律,从而揭示分子的结构、动态和性质等方面的信息。
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