
[物] 分子動力學
In the computer simulations, the Discrete Molecular Dynamics (DMD) method was induced.
在計算機模拟方面,我們引入了離散分子動力學(DMD)方法。
Nuclear magnetic resonance has proved to be very useful in studying molecular dynamics.
核磁共振波譜學在動力學研究上具有非常獨特的優勢。
Cyclic mapping and reduction recursive bisection method were used to parallel the molecular dynamics.
分别用循環映射法和簡化遞歸對剖法實現了分子動力學的并行計算。
In this paper molecular dynamics (MD) simulation was applied to validate COMPASS force field for HMX.
首先通過分子動力學(MD)模拟考察了COMPASS力場對HMX的適用性。
The rheological behavior of nanometer-thick liquid film has been predicted by Molecular Dynamics Simulation.
本文以分子動力學方法模拟了納米級液體薄膜的流變特性。
分子動力學(Molecular Dynamics,MD)是一種基于計算機模拟的計算方法,用于研究原子和分子在特定物理條件下的運動規律及其相互作用。以下是詳細解釋:
分子動力學通過數值求解牛頓運動方程,模拟粒子(如原子或分子)在勢能場作用下的運動軌迹。其核心是計算每個粒子隨時間演化的位置和速度,從而揭示系統的微觀行為。
勢能函數(力場)
描述原子間相互作用的數學模型,如鍵長、鍵角、二面角、範德華力和靜電力。常用力場包括 AMBER、CHARMM 和 GROMOS。
積分算法
如 Verlet 算法或 Leap-Frog 算法,用于離散化時間步長(通常為 1 飛秒)并更新粒子位置和速度。
周期性邊界條件
模拟體系通常被置于周期性重複的“盒子”中,以減小表面效應的影響。
熱力學系綜控制
通過 Berendsen 熱浴或 Nosé-Hoover 方法調節溫度、壓力等參數,模拟不同熱力學條件(如 NVT、NPT 系綜)。
分子動力學通過原子層面的動态模拟,為理解物質行為提供了重要工具,廣泛應用于科研和工業領域。如需具體案例或軟件工具(如 LAMMPS、NAMD)的說明,可進一步探讨。
分子動力學是一種模拟和研究分子系統運動的計算方法。該方法基于牛頓力學和統計力學的原理,通過數值計算來模拟分子的運動軌迹和狀态變化,以揭示分子的結構、動态和性質等方面的信息。在化學、材料科學、生物學、地球物理學等領域廣泛應用。
分子動力學的主要應用領域包括:
分子動力學方法的基本思想是将分子系統中每個分子的運動視為受到原子間相互作用力的牛頓運動,通過求解牛頓方程來得到分子的運動軌迹和狀态變化。其中,原子間相互作用力可以用勢函數表示。分子動力學模拟過程中,通過數值計算方法求解牛頓方程,得到分子的運動軌迹和各種物理量的變化規律,從而揭示分子的結構、動态和性質等方面的信息。
【别人正在浏覽】