
【化】 upstream sequence
在分子生物学中,上游序列(Upstream Sequence) 指位于基因编码区转录起始位点(Transcription Start Site, TSS)5'端的DNA区段。该区域通常包含调控基因表达的关键元件,是基因转录调控的核心区域。
位置特征
以基因的转录起始位点为参照点,其5'方向(即朝向DNA模板链的起始端)的序列称为上游序列。例如,启动子核心区域(如TATA盒)常位于转录起始位点上游-25至-35碱基处(原核生物)或-30至-100碱基处(真核生物)。
核心调控元件
转录调控枢纽
上游序列通过结合转录因子(Transcription Factors),激活或抑制RNA聚合酶的活性,决定基因在特定细胞或条件下的表达水平。例如,激素响应元件(HRE)位于上游,介导激素信号对基因的调控。
物种保守性
关键上游序列(如启动子核心区)在进化中高度保守,例如人类与小鼠的β-珠蛋白基因上游序列相似度达80%,印证其功能重要性。
改造上游序列可优化外源基因表达,如将强启动子(如CMV启动子)插入载体上游,提升重组蛋白产量。
上游序列的突变可能导致疾病,如β-地中海贫血症与β-珠蛋白基因启动子突变相关。
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上游序列 | Upstream Sequence |
转录起始位点 | Transcription Start Site (TSS) |
启动子 | Promoter |
增强子 | Enhancer |
转录因子 | Transcription Factor |
在分子生物学中,上游序列指基因或DNA链中位于转录起始位点5'端方向的区域。以下是详细解释:
DNA链具有方向性,5'端为上游,3'端为下游。以RNA聚合酶的转录起始位点为基准(编号为0),向5'端方向依次为-1、-2等负值位置,向3'端则为+1、+2等正值位置。
上游序列的突变可能改变转录因子结合能力,导致基因表达异常,与疾病或表型变化密切相关。
上游序列是基因表达调控的关键区域,其方向性(5'端)和功能元件(如启动子)共同确保转录的精确性。如需进一步了解具体调控机制,可参考分子生物学教材或专业文献。
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